The Pegasus Saga comes to an end, but a new journey is about to begin! Yugi meets a mysterious Egyptian named Shadi who enters Yugi’s mind with the Millennium Key. What are these Millennium Items, and do they hold the answer to the mystery behind the Shadow Games?

败北后的贝卡斯在房间里遇到了暗貘良。暗貘良的目标是贝卡斯所拥有的千年眼。

貝卡斯兌現承諾，釋放武藤雙六和海馬兄弟。遊戲和朋友們隨後得知他當初為何採取這等極端行動。

En cherchant les âmes de grand-père et des frères Kaiba, Yugi découvre l'histoire de Pégasus et rencontre un personnage très énigmatique.

Tea, Yugi, Tristan und Joey suchen Pegasus. Der hat inzwischen ein Duell gegen den bösen Bakura verloren und muss sein Millenniumsauge hergeben. Pegasus ist am Ende. Derweil findet Tea Pegasus Tagebuch.

Pegasus è scomparso dall'arena, mentre le anime rubate sono tornate nei rispettivi corpi. Bakura, con i poteri dell'anello, sfida il magnate al gioco delle ombre: ancora indebolito dalla lotta con Yugi, Pegasus viene sconfitto facilmente e il suo occhio viene sottratto. Accedendo alla torre, Yugi e gli altri scoprono il diario di Pegasus dal quale apprendono informazioni sul suo passato: da adolescente si innamorò di Cecilia (il cui ritratto è presente nel castello) e, dopo un lungo fidanzamento, i due stavano per sposarsi. L'improvvisa malattia della ragazza fece saltare i piani, causando in seguito la sua morte. Disperato per la perdita, Pegasus si mise alla ricerca degli oggetti del millennio e durante un viaggio in Egitto ricevette l'occhio magico. Ispirato dalla tecnologia olografica dell'industria di Kaiba, aveva l'obiettivo di riportare in vita l'amata grazie al potere degli oggetti e per questa ragione organizzò il torneo.

デュエルに敗れ、自分の部屋に戻っていたペガサスの前に闇獏良が現れる。闇獏良の目的は7つの千年アイテムを手に入れること。すべてがそろえば世界を支配できるほどのパワーを手に入れることができるという。獏良に襲われたペガサスの部屋に残された日記に記された、ある少女の物語とは……!?

Após perder para Yugi, Pegasus liberta as almas de Seto Kaiba, Mokuba e Salomon. Então, Yami Bakura reaparece, mais uma vez, e desafia Pegasus para um combate. Pegasus perde e Yami Bakura rouba dele o olho do milênio. Em seguida, Yugi e seus amigos conseguem olhar o diário de Pegasus, e descobrem mais sobre ele: No passado, Pegasus teve uma esposa chamada Cecília, que ele amava muito, mas ela morreu de uma doença grave pouco depois que os dois se casaram. Pegasus estava usando o olho do milênio e sequestrando as almas das pessoas para tentar fazer um feitiço para trazer Cecília de volta à vida. Logo depois, Yugi encontra Shadi, que possui a Chave do Milênio, outra relíquia milenar. Shadi diz que sente que há um ladrão à solta - o ladrão de que ele fala é Yami Bakura, já que ele roubou o olho do milênio de Pegasus - e pede para Yugi ter cuidado, pois esse ladrão virá atrás de Yugi no futuro.

Yugi ha derrotado a Pegasus y le entrega el dinero del premio a Joey. Mientras tanto, Pegasus libera las almas del abuelo de Yugi y los hermanos Kaiba. Sin embargo, el espíritu maligno del Anillo Milenario de Bakura se apodera del Ojo Milenario de Pegasus. Por otra parte, un hombre misterioso, llamado Shadi, aparece frente a Yugi y entra en su mente con el fin de averiguar quién robó el Ojo, pero solo se encuentra con trampas puestas por el espíritu del Puzzle.