Grand Dragon Leviathan’s thunderous roars unleash hundred-foot tall waves worldwide to destroy every town and city on Earth and wash away all traces of humanity! How can Yugi’s simple soul stop the annihilation of the planet from the greatest natural disaster in history? Billions of lives are at stake in the thrilling conclusion where failure means extinction!

游戏召唤出三幻神打倒了奥利哈刚之神，被吞噬了的灵魂也回到各自体内。这时，集地球上所有的心中的黑暗力量向游戏袭来。

Le monde a été sauvé et Yugi Muto dit adieu aux Chevaliers Légendaires.

Die Last der Welt liegt auf Yugis Schultern. Zwar ist Orichalcos besiegt, der große Leviathan droht jedoch in Form einer Naturkatastrophe die Menschheit zu vernichten. Kann Yugi das verhindern?

三幻神獣の力で巨大竜リヴァイアサンをたおし、とらわれた仲間たちをすくい出す遊戯。しかしダーツは、この地球上すべての心の闇をあつめて最後の大きな攻撃力とし、遊戯を飲みこもうとする。

　遊戯は、さまざまなデュエリストとの出会いを通して知ることができた心の光をしんじて、自分の心の器のすべてでこの闇をうけとめようと、自ら闇に飲みこまれていく。それは大きな炎となって、世界各地で起こった異常現象をもすいこんでいくが…。

Dartz quiere destruir a Yami Yugi con su oscuridad interior, pero Yugi le dice que puede resistir por la luz de la amistad que está con él, así Yami Yugi logra sellar a Leviatán y Este desaparece. Finalmente, Dartz se libera del poder maligno del Oricalcos y vuelve a ser un bondadoso gobernante. Yami Yugi y Yugi se van del lugar y este desaparece en el mar. Todos recuperan sus almas. Yugi, quien fue arrastrado por el mar se encuentra en una isla con los "Caballeros Legendarios" y "Chica Maga Oscura", quienes le agradecen su ayuda. Más tarde, sus amigos llegan para rescatarlo en un helicóptero de Kaiba Corp.