When the clock in the school building strikes midnight, the campus will become "a school for yokais" that cannot be seen with human eyes. Tanaka Kazuo is a human high school student with no friends who is bullied by his classmates. He feels miserable and lonely, believing that he doesn't belongs anywhere. However eveything changes when he discovers the existence of the yokai realm. Hoping to make some friends and to start a new life, he enrolls himself in the school and lies saying that he is a very rare mixed-race yokai called "Tanaka Ichiotoko", despiste the fact that he looks like an ordinary human being. Tanaka's new supernatural classmates are full of surprises, and can't help but suspect of his true nature.

Als de klok in het schoolgebouw middernacht slaat, wordt de campus 'een school voor yokai's' die niet met menselijke ogen te zien is. Tanaka Kazuo is een menselijke middelbare scholier zonder vrienden die wordt gepest door zijn klasgenoten. Hij voelt zich ellendig en eenzaam, in de overtuiging dat hij nergens thuishoort. Alles verandert echter wanneer hij het bestaan ​​van het yokai-rijk ontdekt. In de hoop wat vrienden te maken en een nieuw leven te beginnen, schrijft hij zich in op de school en liegt door te zeggen dat hij een zeer zeldzame yokai van gemengd ras is genaamd 'Tanaka Ichiotoko', ondanks het feit dat hij op een gewoon mens lijkt. Tanaka's nieuwe bovennatuurlijke klasgenoten zitten vol verrassingen en kunnen niet anders dan zijn ware aard vermoeden.

校舎にある時計の針が、まもなく深夜0時を指そうとしている頃、学校は人間に見つからないように妖怪たちが通う『百鬼夜高等学校』となる…。

인간세계의 고등학교에 다니다 인간관계에 지쳐 인간이 없는 곳으로 가기위해 '요괴'들만 다니는 백귀야고등학교에 전학온 인간의 파란만장한 요괴고등학교 적응기. 텐구, 갓파, 유키온나, 주판소년 등등 온갖 요상한 요괴들이 제각기의 개성을 떨치며 재학중인 '요괴고등학교'의 생활상을 그린 B급 병맛코미디물이다. 요괴들이 지지고 볶는 깨알같은 학교생활과 무논리 병맛개그의 묘미를 제대로 느낄 수 있다