Maylu and Chaud meet a train conductor named Al Ferry, operator of train-themed NetNavi ChargeMan. He lives in a village where the railroad network has prospered. However, Zoano JunkDataMan has been threatening the village by eating the tracks, and he sends viruses to cause more mischief. Chaud and Maylu offer to help, and ProtoMan substantiates to battle with JunkDataMan.

炎山和美露与热斗等人失散，来到废墟般的彼方世界。两人遇到在荒野奔驰的货物列车，认识了列车司机-铁国男以及他的领航员-冲锋人。炎山一行人搭著国男的列车来到某城镇。那是一个铁路网络极度发达，风格回异的城镇。在那裏出现了库雷卡军的兽裔废铁人。吞噬铁轨的兽裔废铁人和兽化病毒一起想要攻陷城镇。炎山让布鲁斯实体化，打算制止兽裔废铁人…

熱斗達とはぐれ、廃墟と化したビヨンダードをゆく炎山とメイル。二人は荒野を走る貨物列車と遭遇、運転士の鉄国男とそのナビ、チャージマンと出会う。

国男の列車でとある町へと辿り着いた炎山たち。そこは鉄道網が極度に発達した一風変わった町だった。そこにグレイガ軍のゾアノジャンクマンが出現する。

線路を食らうゾアノジャンクマンは獣化ウイルスと共に町へ攻め込もうとしていた。炎山はブルースを実体化させ、食い止めようとするが…。