Someone who Kazuki thought he'd never see again returns to give him Hino's powerful Mark Sein. During battle with a massive Festum, a childhood memory of Soshi helps him realize his role in protecting Tatsumiya Island.

一騎在戰鬥中面臨被祝福者同化的危機，而執著想見總士的信念拯救了他。因為尋找一騎而去了新國聯的真矢在硝煙漸漸消退的戰場發現了一騎的身影…

一骑在战斗中面临被Festum同化的危机，而执着想见总士的信念拯救了他。因为寻找一骑而去了新国联的真矢在硝烟渐渐消退的战场发现了一骑的身影……

一騎在戰鬥中面臨被祝福者同化的危機，而執著想見總士的信念拯救了他。因為尋找一騎而去了新國聯的真矢在硝煙漸漸消退的戰場發現了一騎的身影…

Les troupes de l'Armée de l'Humanité ont entièrement pris le contrôle de l'île. Sôshi n'arrive pas à comprendre pourquoi Makabe les a laissé faire sans chercher à se défendre, mais celui-ci se refuse à combattre d'autres humains.

Sur l'autre île, Maya et Mizoguchi ont repris leur envol, à la recherche de Kazuki.

C'est alors qu'ils voient surgir des profondeurs de la terre un énorme Festum, poursuivi par un Fafner d'un nouveau type, le Mark Sein. Avec aux commandes un Kazuki déchaîné par la disparition de sa mère qu'il venait à peine de retrouver.

Mais au cour du combat, le jeune garçon est contacté par le noyau de l'île de Tatsumiya...

｢母さん……?｣ファフナー・ザルヴァートルモデル、識別コード・マークザインを届けに来たミョルニアは、一騎の母・紅音がフェストゥムと同化した姿だった。我が目を疑う一騎の目前でイドゥンに飲み込まれるミョルニア。母との残酷な再会と別離に怒りを爆発させた一騎のマークザインは、彼の憤怒そのもののような流動体を接合部より噴出させ、イドゥンや迫り来るアルヘノテルス型の群れを覆いつくす。そして溶岩のような流動体の中から巨大な異形の赤ん坊が姿を現し、咆哮を上げる。恐るべき光景の中心・マークザインの中、一騎は幼い頃の夢を見ていた。総士が左目に負った消えない傷、それは一騎が彼と一緒に遊んでいるうち、誤って傷つけたことになっていた。しかし、マークザインのコア、そして遠くアルヴィスよりの乙姫の導きで本当の記憶を蘇らせる。その時、遺伝子レベルで融合したフェストゥムの本能が覚醒し、一騎と同化しようとしたのは総士の方だったのだ……