Daniele (Michele Riondino), il geniale informatico compagno di Sabina (Giulia Michelini), è coinvolto da Mauro nell'indagine sull'ecomafia: serve il suo aiuto per decrittare il cd rom di Liverani. Giulia decide di coprire i suoi uomini, scatenando le ire del procuratore Altieri (Bruno Armando) che aveva assegnato l'indagine ai carabinieri. Anche Davide è ferito dalla scelta di Giulia, che però gli spiega i suoi dubbi. Nel frattempo Anna e Luca si confrontano su un delicato caso familiare: l'undicenne Stella accusa il proprio patrigno di averla molestata. Intanto i due killer dell'ecomafia (Thomas Trabacchi e Moira Grassi) escogitano un diabolico piano per sottrarre il cd rom in possesso del X Tuscolano: fingendosi due carabinieri con la falsa telefonata di Giulia si introducono nel commissariato ed estraggono il cd rom dal PC prima che questo possa essere decriptato. Mauro scoperto l'inganno dei due killer si precipita assieme ai suoi colleghi all'inseguimento dei due, durante il quale ne scaturisce una sparatoria davanti al commissariato nella quale una di loro (Moira Grassi) viene colpita a morte da Parmesan (Roberto Nobile) per salvare Mauro messo con le spalle al muro dalla stessa; l'altro, inseguito dall'ispettrice Gori, riesce invece a scappare col cd rom.