金田一一（道枝骏佑饰）就读的不动高中有一个被称为学园七大不可思议的谜团。其中一个传说是若有人知道了细节不明的第七个谜团的真相，就会被潜藏在旧校舍的怪人『放学后的魔术师』咒杀。而推理研究社的七瀬美雪（上白石萌歌饰）和社员们开始调查这个谜团。有一天晚上，美雪因为被社长樱树（大友花恋饰）叫出来，与一赶到旧校舍。可是他们在那里目击到的是在“打不开的生物教室”上吊的樱树！她身旁还有一个看起来像是『放学后的魔术师』的身影，但当他们破坏门并踏入其中，看到的是一个空无一人的房间。但樱树的尸体还是在隔天被发现。剑持警部（泽村一树饰）和当时在旧校舍的佐木（岩崎大升饰）等其他研究社的社员们、正好在场的值班警卫立花（杉本哲太饰）、教师的场（光石研饰）展开搜查。美雪感到后悔，她觉得如果当初不调查七大不可思议就不会发生这种事。然而在那之后还是不断有人牺牲，最后就连美雪也…！经过进一步调查，他们发现10年前追寻同一谜团的学生竟然也失踪了。一对犯人感到无比愤怒，他赌上爷爷的名声，发誓绝对会解开谜团。而隐藏在离奇密室杀人事件之谜下壮烈又哀伤的真相究竟是什么？

Hajime Kindaichi theo học tại một trường trung học có bảy bí ẩn được đồn đại, nơi người ta tin rằng bất kỳ ai biết về chúng sẽ bị nguyền rủa, khiến Kindaichi phải cố gắng khám phá nguồn gốc của những bí ẩn