ブラックマグマは上村博士に毒シダを繁殖させるため、博士の亡き愛娘・ユミそっくりのダークQを与えた。博士は心ならずもブラックマグマに協力してしまう。一方、博士と旧知だった美佐は、独自で真相を調査し始める。監禁されていた博士を脱出させるが、そんな博士に銃口を向けたのはユミだった。