昭和27年夏。金田一耕助（古谷一行饰）遇到了在京都山村发生的当地青年贞夫（四礼正明饰）失踪以及接连发生的墓地被掘事件。金田一注意到墓地中名为持田的死者遗体只剩下头骨被盗，他怀疑这与贞夫有关。贞夫是数天前与金田一重遇的高中时代的恋人虹子（丘光子饰）的弟弟。而持田则是虹子的丈夫，据说在他去世时，有人怀疑是虹子毒杀了他。金田一对与虹子的命运般的重逢感到复杂的情感。不久后，贞夫身陷可疑的死亡事件中…

昭和27年夏。金田一耕助（古谷一行）は、京都の山村で地元の青年・貞夫（四禮正明）の失踪と、次々に墓があばかれる事件に遭遇した。金田一は、墓の中で持田という死者の遺体から頭蓋骨だけが盗まれていることに、貞夫との関連があるとにらんだ。貞夫は、数日前に劇的な再会を果たした学生時代の恋人・虹子（丘みつ子）の弟だった。そして持田は虹子の夫だった人物で、亡くなった当時、彼女が毒殺したという疑惑が持たれていたという。運命的かつ皮肉な再会に、金田一は虹子への複雑な思いを抱く。やがて貞夫が不審な死を遂げる…。