ダークマター空間から脱出しようとするユウディアスたちだったが、思い掛けずダークマター帝国の城に侵入してしまう。全ての謎の真相を暴くため、ダークマイスターにデュエルを挑むユウディアス！しかし、激闘を見守る遊飛は、言い知れぬ不安を感じていた…。