在潜水艇得到药的十代赶回去决斗学院。另一方面，在为保护学院而警备的万丈目那边来了几个很怪的学生，并提出「来决斗吧～」的决斗请求。万丈目决斗了，然后一个接着一个地提出决斗请求……回到学院的十代发现本该在警备的学生不见了而感到奇怪，此时出现了奇怪的学生带着「来决斗吧～」的请求。察觉到学院奇怪状况的十代会……

À l'Académie, une révélation sur les groupes bio est révélée. Au fur et à mesure que les étudiants perdent leur énergie, ils deviennent des goules Duel, comme Chazz et Syrus.

Jaden, Jesse und Co. erreichen mit den Medikamenten die Akademie. Zu ihrer Überraschung treffen sie dort keine Studenten mehr. Nach langem Suchen begegnen ihnen ein paar Mitschüler, die sich äußerst seltsam benehmen. Auch Chazz und Syrus reden ganz eigenartig und fordern Jaden zum Duell heraus …

Mentre un esercito di Duel Ghouls si impadronisce lentamente della Duel Academy, Jaden e i suoi amici possono trovare un modo per duellare questi demoni, o verranno tutti addestrati nel processo?

潜水艦で薬を見つけた十代たちは急ぎデュエルアカデミア向かう。一方、学園を守るために警備していた万丈目ところに怪しい生徒たちが来て、「デュエルしよう～」とデュエルを申し込む。デュエルをする万丈目だったが、次から次にデュエルを申し込まれ・・・・。学園に到着した十代たちは警備をしているはずの生徒がいないことに不審に思っていると、どこからともなく生徒が現れ「デュエルしよう～」と声をかけてくる。学園の異常に気付いた十代たちは・・・・