桂小五郎から長州藩に招かれた蔵六は大村益次郎と改名し、兵力強化に尽力。また、坂本龍馬の奔走で薩長同盟が結ばれ、時勢は一気に倒幕へと傾きます。慶応２年（１８６６）、長州に攻め込んだ旧態依然の幕府軍を、益次郎ら長州軍は近代戦法で撃退しました。同年、海軍総督として指揮していた高杉晋作が病に倒れます。慶応３年（１８６７）、「奇兵隊は大村（益次郎）を仰げ」と言い残し、２７歳という若さでこの世を去りました。