ゴーレムに占拠された終末世界を来美(中条あやみ)と共に生き抜いた響(竹内涼真)。仲間たちとの生活を続ける響はある日、食料調達に向かった街から物資が消え、謎の印が付けられたゴーレムの死体が増えているのに気づく。そんな中、シェルター「希望の家」から来たという謎の男・野呂(吉沢悠)が現れるが、何か隠している様子で……。一方、臨床実験が原因で体に異変が出始めた来美は、自分の感染を疑っていた。時々記憶が曖昧な時間があることに不安を感じる来美。さらにゴーレムのいないはずの島で仲間がゴーレム化する事件が発生!疑惑の目は来美に向けられて……。再び仲間の間に生じる亀裂、症状の進む来美……。そんな来美の前に、シェルターの住人・秋吉(本郷奏多)が現れ……。新たな試練の数々が響を襲う!

골렘으로 뒤덮인 종말 세계를 쿠루미와 함께 살아남은 히비키. 동료들과 사루노시마에서의 생활을 계속하는 히비키는 어느 날, 식료 조달을 위해 향한 도시에서 물자가 사라지고 의문의 표시가 남겨진 골렘의 사체가 증가하고 있는 것을 발견한다. 그런 가운데 피난처 ‘희망의 집’에서 왔다고 자신을 소개하는 수수께끼의 남자는 무언가를 숨기는 듯한 모습으로 히비키와 함께 가기를 원한다. 한편, 임상 시험으로 몸에 이상이 생기기 시작한 쿠루미는 자신이 감염된 것은 아닌지 의심하고, 설상가상으로 골렘이 있을 리 없는 사루노시마에 골렘에 의한 습격 사건이 일어난다.