The MIU discovers that Etori was taking orders from a mysterious youth. Suspecting that Kuzumi is the culprit, Shima and his team set out to find him.

伊吹和志摩追踪的Etri被无人机投下的炸弹炸死了。根据司法解剖结果，Etri的真实身份是五年前发生的杀人案的嫌疑人。伊吹等人想知道是谁、为了什么目的要杀死Etri。经1机搜的糸卷调查，他们得知，Etri经常在某个熟悉系统开发的年轻男子的指示行动。志摩怀疑那个年轻男人就是叫久住的人。如今关在拘留所的高中生成川认识久住。桔梗指示九重和阵马从成川口中问出久住的消息，又指示伊吹和志摩搜查证据。4机搜团结一心追查炸弹犯的下落。另一方面，播客REC从代替被捕的成川的自称“滨田”的人那里获得了有关无人机爆炸案相关的机密档案。

與看不見的敵人之戰 第4機動捜査隊的存亡危機!

伊吹（綾野剛）と志摩（星野源）が追っていたエトリが、ドローンに仕掛けられた爆弾で死んだ。司法解剖の結果、エトリの正体は５年前に起きた殺人事件の容疑者であることが判明。誰が何の目的で彼を殺したのか？ １機捜の糸巻（金井勇太）の調べで、エトリはいつも、システム開発に詳しい若い男の指示を受け行動していたことがわかる。志摩はその若い男こそ、久住（菅田将暉）という男ではないかと考える。久住と面識があるのは留置場にいる高校生の成川（鈴鹿央士）だ。桔梗（麻生久美子）は、成川から久住について聞き出すよう九重（岡田健史）と陣馬（橋本じゅん）に指示。そして、伊吹と志摩にはその裏付け捜査をするよう指示し、４機捜が一丸となって爆弾犯の行方を追うが…。一方、ナウチューバー・REC（渡邊圭祐）は、逮捕された成川に代わり「浜田」と名乗る情報源から、ドローン爆発事件に関する極秘ファイルを受け取る。

이부키와 시마가 쫓고 있던 에토리가 드론에 장치된 폭탄에 의해 사망한다. 사법 해부 결과, 에토리의 정체는 5년 전에 발생한 살인 사건의 용의자로 판명된다. 누가 어떤 목적으로 그를 죽인 것인가? 1기수의 이토마키의 조사로 에토리는 언제나 시스템 개발을 잘 아는 젊은 남자의 지시를 받고 행동했다는 것을 알게 된다. 시마는 그 젊은 남자가 쿠즈미라는 남자가 아닐까 생각하고, 쿠즈미와 면식이 있는 고등학생 나리카와와 접촉한다. 키쿄는 코코노에와 진바에게 나리카와에게서 쿠즈미에 대해 캐물어 내라고 지시한다. 그리고 이부키와 시마에게는 뒷받침 수사를 하도록 지시하고 4기수가 똘똘 뭉쳐 폭탄범의 행방을 쫓는데...

Zespół MIU odkrywa, że Etori otrzymywał rozkazy od tajemniczego młodzieńca. Podejrzewając, że sprawcą jest Kuzumi, Shima i jego zespół wyruszają, aby go odnaleźć.

Etori estava seguindo ordens de um mandante misterioso. Desconfiando de Kuzumi, Shima e sua unidade decidem ir atrás dele.